Deteksi Gen alg44, oprL dan toxA pada Pseudomonas aeruginosa Isolat Klinis dengan Metode Polymerase Chain Reaction

Authors

  • Zana Zalianti Program Studi D-III Teknologi Laboratorium Medis, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional
  • Umiyati Nur Hidayah Program Studi D-III Teknologi Laboratorium Medis, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional
  • Tasya Ovtavianty Ferlita Dewi Program Studi D-III Teknologi Laboratorium Medis, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional
  • Didik Wahyudi Program Studi D-III Teknologi Laboratorium Medis, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional

DOI:

https://doi.org/10.21460/sciscitatio.2025.62.225

Keywords:

alg44, oprL, toxA, Pseudomonas aeruginosa, PCR

Abstract

Gen alg44, oprL dan toxA merupakan gen yang berperan dalam faktor virulensi pada bakteri Pseudomonas aeruginosa yang dapat menyebabkan infeksi kronis pada manusia. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi adanya gen alg44, oprL dan toxA pada Pseudomonas aeruginosa dengan menggunakan isolat klinis berupa sputum, urine dan pus dengan metode Polymerase Chain Reaction. Penelitian ini dimulai dengan melakukan karakterisasi dari 6 sampel isolat klinis Pseudomonas aeruginosa yang berupa sputum, urine dan pus (masing-masing 2) melalui uji mikroskopis, makroskopis dan uji biokimia. Proses isolasi DNA bakteri menggunakan Presto Mini gDNA Bacteria Kit, hasil dari isolasi DNA dilakukan uji kualitatif elektroforesis gel agarosa dan uji kuantitatif dengan Spekrofotometer UV-Vis. Deteksi gen dilakukan pada enam sampel DNA Pseudomonas aeruginosa menggunakan metode Polymerase Chain Reaction dengan primer spesifik. Hasil dari PCR menyatakan bahwa gen alg44, oprL dan toxA terdeteksi pada semua isolat Pseudomonas aeruginosa.

References

Auda, I. G., Kadmy, I. M. S. A. L., Ali, A. N. M., Muslim, S. N., & Salman, I. M. (2015). toxA Gene as a Chromosomal Marker for Rapid Identification of Otitis Media Pseudomonas Aeruginosa. Int'l Journal of Advances in Chemical Engg, & Biological Sciences, 2 (1).

Bergey, D. H. (1994). Bergey's manual of determinative bacteriology. Lippincott Williams & Wilkins.

Chand, Y., Khadka, S., Sapkota, S., Sharma, S., Khanal, S., Thapa, A., Rayamajhee, B., Khadka, D. K., Panta, O. P., Shrestha, D., & Poudel, P. (2021). Clinical Specimens are the Pool of Multidrug- resistant Pseudomonas aeruginosa Harbouring oprL and toxA Virulence Genes: Findings from a Tertiary Hospital of Nepal. Emergency Medicine International, 2021, 1–8.

Ciamak, G. (2022). Pseudomonas aeruginosa: Prevalence of Pathogenic Genes, OprL and ToxA in Human and Veterinary Clinical Samples in Ardabil, Iran, 2020. Journal of Advanced Biomedical Sciences.

de Sousa, T., Silva, C., Igrejas, G., Hébraud, M., & Poeta, P. (2025). The Interactive Dynamics of Pseudomonas aeruginosa in Global Ecology. Journal of Basic Microbiology, 65(4), e70004.

Djasfar, S.P & Pradika,Y. (2023). Identifikasi Bakteri Penyebab Infeksi Nosokomial (Pseudomonas aeruginosa) Pada Lantai Intensive Care Unit (ICU). Jurnal MedLab, 2(1).

Dong, D., Zou, D., Liu, H., Yang, Z., Huang, S., Liu, N., He, X., Liu, W., & Huang, L. (2015). Rapid detection of Pseudomonas aeruginosa targeting the toxA gene in intensive care unit patients from. fortiers in Microbiology, 6, 1–7. https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.01100

Gawad, M. A., & Gharbi, W. A. (2022). Molecular Detection of oprI and oprL Virulence Genes of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Burns and Wounds. In Iraqi Journal of Biotechnology (Vol. 21, Issue 2).

Hattab, J., Guardiani, P., & Tiscar, P. G. (2021). Occurrence , antimicrobial susceptibility , and pathogenic factors of Pseudomonas aeruginosa in canine clinical samples. Vet World.14, 978–985.

Khosravi, A. D., Shafie, F., Montazeri, E. A., & Rostami, S. (2016). The frequency of genes encoding exotoxin A and exoenzyme S in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from burn patients. Burns, 42(5), 1116-1120.

Presto™ Mini gDNA Bacteria Kit Quick Protocol. (2016). Bacteria genomic DNA extraction kit optimized for genomic and viral DNA purification from Gram negative bacterial cells and Gram positive bacterial cells. Geneaid Biotech Ltd, Taiwan.

Qin, S., Xiao, W., Zhou, C., Pu, Q., Deng, X., Lan, L., Liang, H., Song, X., & Wu, M. (2022). Pseudomonas aeruginosa: pathogenesis, virulence factors, antibiotic resistance, interaction with host, technology advances and emerging therapeutics. Signal Transduction and Targeted Therapy, 7:199, 1–27. https://doi.org/10.1038/s41392-022-01056-1

Reid, G. A. (1991). Molecular cloning: A laboratory manual, 2nd edn: by J. Sambrook, EF Fritsch and T. Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, (3 vols; 1659 pages) ISBN 0 87969 309 6.

Syarif, M. R., Kurniawaty, E., & Rahmanisa, S. (2024). Resistensi Antibiotik terhadap Pseudomonas aeruginosa: Literature Review. Medical Profession Journal of Lampung, 14(8), 1659-1663.

Wahyudi, D., & Soetarto, E. S. (2021). Pembentukan Biofilm Pseudo monas aeruginosa pada Beberapa Media Cair. Jurnal Farmasi (Journal of Pharmacy) , 10(2), 35-40.

Wahyudi, D., Aman A. T., Handayani, N. S. N., & Soetarto, E. S. (2019). Differences among clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in their capability of forming biofilms and their susceptibility to antibiotics. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 20(5).

Wahyudi, D., Silviani, Y., Nirwana, A. P., & Saroh, D. (2024). Deteksi Gen Resisten Kloramfenikol (cat) pada Isolat Klinik Pseudomonas aeruginosa dan Escherichia coli dengan Metode Polymerase Chain Reaction. SCISCITATIO, 5(1), 10-19.

Wahyudi, D., Wimpy, & Saroh, D. (2022). Detection of Gene Alg8 And Alg 44 in Clinical Isolates Pseudomonas aeruginosa Using Polymerase Chain Reaction Method. Indonesian Journal of Global Health Research, 4(4).

Zhou, E., Seminara, A. B., Kim, S. K., Hall, C. L., Wang, Y., & Lee, V. T. (2017). Thiol-benzo-triazolo-quinazolinone Inhibits Alg44 Binding to c-di-GMP and Reduces Alginate Production by Pseudomonas aeruginosa. ACS Chemical Biology, 12(12), 3076–3085.

Downloads

Published

31-07-2025

How to Cite

Zalianti, Z., Hidayah, U. N., Dewi, T. O. F., & Wahyudi, D. (2025). Deteksi Gen alg44, oprL dan toxA pada Pseudomonas aeruginosa Isolat Klinis dengan Metode Polymerase Chain Reaction. SCISCITATIO, 6(2), 98–107. https://doi.org/10.21460/sciscitatio.2025.62.225